El Liceo de Nicoya fue seleccionado entre 6 de los colegios del país para la implementación del plan piloto de secciones bilingües, la cual, inició en el 2017 siendo director el Msc. José Luis Ramírez Obregón. Después de la divulgación que se hizo en el 2016, para que toda la comunidad pudiera optar por un espacio en el grupo que se iba a abrir en el curso lectivo 2017. Una vez realizada la prueba de admisión de secciones bilingües, 35 estudiantes fueron seleccionados para formar parte de este nuevo proyecto que se estaba implementando en el país.

En el 2017, se retoma el proceso una vez más y 34 estudiantes ingresan en el curso lectivo 2018. Para los cursos lectivos, 2019 y 2020, la dirección y la coordinación de secciones bilingües aumentan la cantidad de secciones a dos por nivel.

Actualmente, el colegio cuenta con 6 secciones bilingües distribuidas de la siguiente forma:

Después de realizar varios informes de parte de los coordinadores y los asesores nacionales ante al MEP. El Ministerio de Educación Publica avala para que el Plan Piloto se implemente como un valor agregado a instituciones académicas del país. Este aval fue dado durante el curso lectivo 2019.